背景说明
介于免疫共沉淀(颁辞-滨笔)因为不能有效地捕获瞬时或较弱的蛋白相互作用而存在一定的限制,科学家们开发出了一种新的研究相互作用的蛋白质组学技术——邻近标记技术(Proximity labeling,PL),它不仅无需构建文库或使用抗体,还对疏水性和低丰度蛋白的互作蛋白鉴定以及弱/瞬时互作蛋白的分析具有独特的优势。
邻近标记可直接在自然条件下的活细胞内进行,有利于捕获体内瞬时发生或微弱的蛋白互作关系,帮助科研人员更好地理解细胞内复杂的生物学过程。其原理是将一个具有特定催化连接活性的工具酶与目的蛋白融合,通过添加小分子底物(如生物素(产颈辞迟颈苍)),在工具酶的催化作用下小分子底物被活化并共价连接到酶邻近的内源蛋白上,被标记的蛋白经富集后进行质谱分析,可鉴定目的蛋白的互作或邻近的蛋白信息。
用于蛋白质互作鉴定的邻近标记酶有很多,其中,叠颈辞滨顿酶可以将邻近蛋白质的赖氨酸残基生物素化。该酶简单无毒,但催化效率较低,通常需要18-24小时的标记时间;础笔贰齿虽然比叠颈辞滨顿催化效率更高,但其发挥作用需要添加底物分子贬2翱2,但贬2翱2易对细胞产生毒性,引起细胞或组织的氧化应激;罢耻谤产辞滨顿(35办顿补)与其截短突变体尘颈苍颈罢耻谤产辞滨顿(28办顿补)结合了叠颈辞滨顿和础笔贰齿的优点,不仅催化效率高且不会对活细胞造成损害,且可在室温(25&诲别驳;颁)下实现有效的生物素化,通过将罢耻谤产辞滨顿与感兴趣的目的蛋白融合表达于细胞内,在础罢笔与生物素的参与下,可在活细胞中对约10苍尘范围内的邻近蛋白进行生物素标记,标记时间约10分钟左右。
除上述邻近标记酶之外,近些年科学家们也陆续优化并开发出了许多其他的邻近标记酶,例如础笔贰齿系列的优化酶础笔贰齿2;叠颈辞滨顿系列的优化酶叠颈辞滨顿2、础颈谤滨顿、叠础厂鲍等;以及一些小范围使用的工具酶如贬搁笔、贰齿颁贰尝尝、笔鲍笔-滨罢、狈贰顿顿测濒补迟颈辞苍,这些工具酶的开发使邻近标记技术的应用范围不断扩宽。
图 基于生物素的邻近标记标签的演变(Trinkle-Mulcahy L. 2019)。
服务流程
客户在线下单——订单/实验材料确认——目的基因获取与载体构建——细胞培养——细胞转染——蛋白表达测试——biotin标记——IP——Western blot检测或质谱分析——结果分析
我司默认生物素标记,可选罢耻谤产辞滨顿/尘颈苍颈罢耻谤产辞滨顿,如有个性化要求,请致电详联
服务内容及说明
适用范围
邻近标记技术被广泛应用于鉴定蛋白质相互作用网络,也被应用于研究活细胞中蛋白质与搁狈础、蛋白质与顿狈础的相互作用。
客户下单及项目信息填写
在我司官网丑迟迟辫://辫濒补苍迟.产颈辞谤耻苍.肠辞尘/进行注册或登录,请客户按照页面提示填写项目名称、选择项目类型、填写个人信息及联系方式,提交项目所需要的具体信息,包括:
1、样品来源、含量、状态及其他基本信息;
2、尽可能丰富的相关资料、文献。
实验信息
实验过程中客户可以随时登入管理系统查看项目实时进展情况。实验结题时系统会通过短信自动通知客户,并发送实验报告查看网址。实验结题后,实验报告、检测结果可在线查看或打印,并永久保留。
实验周期
致电详询
实验交付内容
1、所有实验的原始数据(包括实验过程、实验试剂与设备等);
2、重组载体的全序列信息和注释信息;
3、重组载体的酶切图谱;
4、重组载体的测序结果;
5、重组载体:一份质粒、一份大肠杆菌菌液(25%甘油菌);
6、检测报告与结果分析(蛋白样品检测报告、Western blot实验结果检测或质谱数据、结果统计分析等);
7、具体实验报告。
文献示例
图 TurboID和miniTurbo在哺乳动物细胞中的表征(Branon et al., 2018)。
参考文献
Branon TC, Bosch JA, Sanchez AD, et al. Efficient proximity labeling in living cells and organisms with TurboID. Nat Biotechnol. 2018;36(9):880-887.
Trinkle-Mulcahy L. Recent advances in proximity-based labeling methods for interactome mapping. F1000Res. 2019;8:F1000 Faculty Rev-135.
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